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東北林業大學于1954年始設林學和林工研究班,標志著研究生教育的開始。1955年設林業經濟研究班。到1957年,共招收研究生80人。研究班均由原蘇聯專家講課,培養兩年制研究生。1958-1960年停止招生。1961年開始恢復招生,到1964年又招收研究生13人。1965-1977年又停止招生。1978年再次恢復招收研究生。1981年被國務院學位委員會批準為首批博士、碩士授予單位。2011年11月成立研究生院。
截止到2013年9月共培養畢業研究生12235人,其中:授予博士學位1411人,學術型碩士學位8063人,全日制專業學位249人,非全日制專業碩士學位2509人,外籍博士3人。學,F有在學研究生6635人,其中:博士生951人,學術型碩士研究生2454人,全日制專業學位研究生698人,非全日制專業學位研究生2532人。
學科分布覆蓋農、理、工、經、管、文、法、醫、藝9個門類,涉及34個一級學科。其中:擁有8個一級學科博士點、44個二級學科博士點,19個一級學科碩士點、136個二級學科碩士點、10個種類33個領域的專業學位碩士點。擁有2個一級學科國家重點學科、12個二級學科國家重點學科、6個國家林業局重點學科、1個黑龍江省重點學科群、7個黑龍江省重點一級學科。目前擁有博士生導師226人,其中兼職博導59人,碩士生導師667人。
擁有優良的教學科研基地和實踐教學基地。有林木遺傳育種國家重點實驗室、國家重點野外科學觀測臺站(帽兒山森林生態系統定位站)、生物資源生態利用國家地方聯合工程實驗室;有1個教育部“長江學者和創新團隊發展計劃”創新團隊;有森林植物生態學、生物質材料科學與技術、東北油田鹽堿植被恢復與重建3個教育部重點實驗室,4個國家林業局重點實驗室,5個黑龍江省重點實驗室,7個省教育廳重點實驗室;有1個教育部工程研究中心,1個高等學校學科創新引智基地,2個國家林業局生態系統定位研究站,1個省中試基地,1個省哲學社會科學研究基地,3個省普通高校人文社會科學重點研究基地,2個省中小企業共性技術研發推廣中心;有東北林業大學大慶生物技術研究院、植物資源生態與分子工程研究院、國家林業局貓科動物研究中心等48個研究機構;有帽兒山實驗林場、涼水實驗林場等8個校內實習基地和214個校外實習基地。全國百篇優秀博士學位論文獎獲得者4人、提名獎獲得者2人。
研究生院現設有9個科室,有管理人員16人,主要負責學位與研究生教育的管理工作。
東北林業大學是中國學位與研究生教育學會農林學科工作委員會副主任委員單位,農林學科工作委員會學科建設組組長單位,東北地區農林院校研究生教育協作組組長單位,全國工程碩士專業學位林業工程領域組長單位,黑龍江省學位與研究生教育學會專業學位專業委員會掛靠單位。
(統計數字截止2013年9月)